CDTI vs deducción fiscal I+D+i: comparativa y reglas de compatibilidad

Las dos vías

España articula su política de incentivo a la I+D+i empresarial sobre dos instrumentos principales:

• CDTI (Centro para el Desarrollo Tecnológico Industrial): entidad pública que financia proyectos I+D+i empresariales mediante distintas modalidades (subvención, ayuda parcialmente reembolsable, coinversión).
• Deducción fiscal por I+D+i (art. 35 de la Ley 27/2014, LIS): minoración de la cuota íntegra del Impuesto sobre Sociedades en función del gasto en actividades I+D+i, potencialmente reforzada por Informe Motivado vinculante (RD 1432/2003).

Ambas vías son compatibles sobre el mismo proyecto bajo reglas específicas, pero su lógica operativa es distinta: CDTI opera ex-ante (decisión sobre proyecto antes o durante la ejecución), la deducción opera ex-post (ya en la liquidación del IS).

Tabla comparativa nuclear

Criterio	CDTI	Deducción fiscal art. 35 LIS
Naturaleza	Subvención / ayuda parcialmente reembolsable / coinversión	Reducción de cuota del Impuesto sobre Sociedades
Audiencia evaluadora	CDTI (entidad pública)	Hacienda (Agencia Tributaria)
Momento de aplicación	Pre-financiación o durante el proyecto	Post-ejecución, con la liquidación del IS
Instrumento técnico de defensa	Memoria CDTI + plan de hitos + justificación post	Memoria + certificación UNE 166.001 + Informe Motivado
Decisión sobre el proyecto	CDTI evalúa elegibilidad y viabilidad ex-ante	Hacienda revisa ex-post (típicamente vía IM)
Tipo de empresa	Cualquier tamaño, desde startup a multinacional	Cualquier empresa con base imponible deducible
Coste de gestión	Memoria CDTI + justificación + auditoría CDTI	Memoria + tarifa entidad certificadora + tasa MICIN
Liquidez	Anticipo o reembolso parcial durante el proyecto	Reduce cuota del año fiscal
Riesgo	Devolución total/parcial si no se justifica el proyecto	Recalificación por Hacienda si no se documenta bien
Compatibilidad entre sí	No se puede deducir gasto ya subvencionado por CDTI	No se puede deducir gasto ya subvencionado por CDTI

Detalle de cada vía

CDTI: cinco modalidades principales

PID — Proyectos de Investigación y Desarrollo. Es la línea más utilizada. Ayuda parcialmente reembolsable a proyectos individuales de I+D+i con un fuerte componente técnico. Plazo: típicamente 12–36 meses. Beneficiario: empresa establecida con capacidad técnica y financiera para ejecutar el proyecto. Tramo no reembolsable (subvención implícita) más tramo a reembolsar a tipo bonificado.

NEOTEC. Subvención a la creación y consolidación de empresas de base tecnológica (spin-offs universitarios, startups deeptech). No reembolsable cuando los hitos se cumplen. Beneficiario: empresa de menos de 3 años (en fase de creación) o de 3–7 años (en fase de consolidación).

Misiones Ciencia e Innovación. Consorcios público-privados orientados a grandes retos tecnológicos. Plazos largos (3–5 años), presupuestos altos (varios millones por consorcio). Beneficiario: agrupación de varias empresas + centros tecnológicos.

Cervera. Proyectos de transferencia tecnológica entre empresa y centros tecnológicos acreditados (CCTT). Beneficiario: empresa que subcontrata la actividad I+D+i a un centro tecnológico acreditado por CDTI.

INNVIERTE. Coinversión en empresas tecnológicas a través de fondos de capital riesgo. Beneficiario: empresa tecnológica con potencial de escalado, en fase de financiación serie A/B típicamente.

Cada modalidad tiene su propio formato de memoria, criterios de evaluación, plazos y porcentajes de financiación. La elección de modalidad es estratégica: una memoria diseñada para PID no encaja directamente en Misiones, y viceversa.

Deducción fiscal art. 35 LIS

La deducción se aplica sobre el gasto en I+D+i del ejercicio fiscal y reduce la cuota del Impuesto sobre Sociedades. La normativa actual está en la Ley 27/2014 (LIS), que sustituyó al anterior TRLIS (RDLeg 4/2004, derogado).

Tramos principales:

• Investigación y Desarrollo (I+D): porcentaje sobre gasto que varía según evolución del gasto frente a media de los dos años anteriores (incentivo al incremento).
• Innovación Tecnológica (IT): porcentaje fijo sobre gasto.
• Adicionales por personal investigador en plantilla.

Para máxima seguridad jurídica, la deducción se acompaña de:

• Certificación UNE 166.001 del proyecto por entidad acreditada por ENAC.
• Informe Motivado vinculante del MICIN bajo procedimiento del RD 1432/2003.

Sin estos dos documentos, la empresa puede aplicar la deducción pero asume todo el riesgo probatorio en una eventual inspección.

Reglas de compatibilidad

La compatibilidad entre CDTI y deducción fiscal sobre el mismo proyecto se rige por una regla nuclear: no se puede deducir gasto que ya ha sido subvencionado por CDTI (sería doble beneficio sobre el mismo gasto, no permitido).

Ejemplo de combinación

Proyecto con presupuesto total de 1.000.000 €, ejecutado en 2 años:

• CDTI aprueba PID con financiación de 500.000 € (300.000 € no reembolsables + 200.000 € a reembolsar a tipo bonificado).
• Empresa asume 500.000 € con recursos propios.

Cálculo de la deducción fiscal:

• Base deducible = 500.000 € (solo la parte propia, no la subvencionada).
• Aplicar el porcentaje del art. 35 LIS sobre esa base.
• La parte reembolsable del PID se descuenta del cómputo porque, aunque la empresa la devuelva, no se puede tratar como gasto deducible ex-post.

Lo que se puede hacer

• Aplicar deducción fiscal sobre la parte de gasto propio de un proyecto que también recibe CDTI.
• Pedir Informe Motivado tipo a) sobre el proyecto completo (incluyendo parte CDTI-financiada y parte propia), aunque la deducción solo aplique sobre la parte propia.
• Aplicar bonificación de personal investigador (RD 475/2014) sobre el personal adscrito al proyecto, calculada de forma compatible con la deducción.

Lo que no se puede hacer

• Deducir el gasto subvencionado por CDTI: doble beneficio.
• Aplicar deducción y subvención CDTI sobre la misma factura.
• Solicitar Informe Motivado sin certificación UNE 166.001 previa.

Cuándo conviene cada vía

CDTI conviene cuando:

• La empresa necesita financiación inicial para arrancar o sostener el proyecto. La vía fiscal no aporta liquidez: solo reduce cuota tributaria al final del ejercicio.
• El proyecto es plurianual y la empresa quiere asegurar la financiación a lo largo de todo el ciclo (CDTI compromete la ayuda al inicio).
• La empresa valora la señal externa que aporta una aprobación CDTI ante inversores, socios o clientes.
• La empresa es PYME o startup sin base imponible suficiente para aprovechar la deducción fiscal en el ejercicio.
• El proyecto tiene componente de transferencia con CCTT (línea Cervera) o consorcio público-privado (Misiones).

Deducción fiscal conviene cuando:

• La empresa tiene base imponible deducible suficiente y prefiere autonomía total en la ejecución del proyecto sin la disciplina de hitos y justificación de CDTI.
• El proyecto es anual o plurianual con liquidez propia y no requiere anticipos.
• La empresa prefiere operar con calendarios fiscales predecibles sin la variabilidad de plazos administrativos de CDTI.
• El proyecto es maduro (ejecutado o casi ejecutado) y la empresa quiere monetizar su esfuerzo I+D+i ex-post.
• La empresa tiene actividad I+D+i recurrente y el flujo deductivo sostenido aporta más valor que ayudas puntuales.

Combinación

Frecuentemente la decisión no es excluyente. Una empresa con I+D+i sostenida puede:

• Presentar a CDTI los proyectos donde necesita financiación inicial.
• Aplicar deducción fiscal sobre la actividad I+D+i no cubierta por CDTI (gastos generales, personal no adscrito a proyecto CDTI específico, otros proyectos paralelos).
• Combinar bonificación de personal investigador (RD 475/2014) con ambas vías.

La estrategia óptima depende del perfil financiero de la empresa, del tipo y volumen de proyectos, y de la previsión de actividad I+D+i a 3–5 años.

Errores típicos

• Doble deducción. Deducir el gasto subvencionado por CDTI. Suele detectarse en inspección y produce regularización fiscal con intereses.
• Memoria reutilizada sin reescritura. La memoria CDTI no sirve directamente para certificación UNE 166.001 + IM. Audiencias distintas, criterios distintos.
• No reservar la trazabilidad documental desde el inicio del proyecto. La separación de gasto subvencionado vs propio se debe llevar contablemente desde el día uno.
• Asumir que CDTI implica deducción automática. No: son dos procedimientos independientes, la aprobación CDTI no califica el proyecto a efectos del art. 35 LIS.
• Pedir IM sin certificación UNE 166.001. El MICIN rechaza solicitudes sin certificación previa válida.

Conclusión

CDTI y deducción fiscal del art. 35 LIS son las dos vías principales de incentivo I+D+i en España con lógicas operativas distintas (financiación ex-ante vs incentivo fiscal ex-post) pero compatibles sobre el mismo proyecto bajo reglas claras de no concurrencia. La elección entre vías no es excluyente: empresas con I+D+i recurrente suelen combinar ambas, articulando bonificación de personal investigador como tercer ingrediente cuando aplica. La condición previa para una combinación segura es llevar contabilidad separada por origen de financiación desde el inicio del proyecto y documentar la trazabilidad técnica que servirá tanto para CDTI como para certificación

• IM.